山东省渔业船舶检验局是主管全省渔业船舶及其产品的法定机构，下设办公室、监督处、技术处、财务审计处等4个职能处室。
山东省渔业船舶检验局负责全省渔业船舶登记和渔业船舶检验工作；负责全省渔港水域交通安全秩序的维护与管理；负责渔业船舶及其产品的法定检验；组织实施渔业船舶修造企业生产条件认可制度；对全省渔业船舶建造质量进行监督检查；协助有关部门做好渔民培训工作；受委托承担国际渔业船舶检验和对外渔业船舶验证工作。内设5个科（室）：办公室、监督处、技术处、财务审计处、政治处。